מפגש שישי- 2.2.26

דן עופר, דוקטורנט לביולוגיה החוקר LLMs, סיפר על ProteinBERT ומודלי שפה ביולוגיים. הוא הדגים כיצד ניתן לנתח רצפי חלבונים או וירוסים בעזרת Deep Learning ולהסיק מהם מסקנות, למשל האם חלבון אחראי לפעילות מסוימת, או האם וירוס הוא אלים אך מצליח לחמוק מזיהוי של מערכת החיסון.  לקריאה נוספת:

ProteinBERT: a universal deep-learning model of protein sequence and function
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/8/2102/6502274

The language of proteins: NLP, machine learning & protein sequences
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.03.022